OFFIS entwickelt IT-gestützte Methoden zur Analyse, Gestaltung und Optimierung von Prozessen in der innerbetrieblichen und maritimen Logistik sowie in der Produktentwicklung. Letzteres insbesondere in den Anwendungsbereichen Automotive und Halbleiterentwurf. Zum Einsatz kommen unter anderem Methoden zur Modellierung komplexer Systeme, um Beziehungen und Zusammenhänge zwischen Prozessschritten zu identifizieren und Prozesse optimal zu gestalten.